Die Versionsdifferenz bei den Entwicklungsversionen ist gewollt - das macht unter anderem die Updatesuche einfacher.
Bei den Problemen müsste ich mir das bei Gelegenheit genauer anschauen, aber bei GC3D2DZ sind D, T und Größe unterschiedlich, bei GC5Q8MR D und T. Bei dem Rest habe ich keine Ahnung, es gibt aber teilweise anwendungsintern (oder in den verfügbaren Daten) Rundungsprobleme bei den Koordinaten. Ob allgemein eine Änderung der Ähnlichkeit von 80 % auf einen niedrigeren Wert etwas bringt, keine Ahnung. Zumindest teilweise sollte aber die geplante Wiedereinführung der Übersetzungstabelle GC -> OC nach Angaben der Owner etwas bringen.
Zur Geschwindigkeit: Keine Ahnung, aber erfolglose Suchen werden temporär gespeichert und nicht wiederholt. Bereits auf OC geloggte Caches werden zudem nicht mit angezeigt und es gibt auch - wie du bereits gesehen hast - möglicherweise False Negatives, zudem sind nicht alle GC-Caches auch bei OC.