Die .gitignore-Datei befindet sich jetzt im Repository. Sie enthält eine Liste aller Dateien, die auf allen Codeinstallationen ignoriert werden sollen. Nur lokal benötigte Ignores müssen ab sofort in .git/info/exclude eingetragen werden.
Es kann sein, dass Git euch beim nächsten Auschecken anmeckert, weil ihr schon eine .gitignore-Datei habt die nicht überschrieben werden kann. Am besten benennt ihr die Datei vorher um, schaut dann welche Einträge in der neuen .gitignore fehlen und schreibst sie nach .git/info/exclude.